Le 28 août, les membres d'équipage principaux et de secours du vaisseau spatial habité par le transport Soyuz МS-06 ont suivi leur formation finale au Cosmodrome de Baïkonour.
Ce jour même, une réunion de gestion technique a été organisée, où une décision a été prise pour alimenter le Soyouz MS-06 avec des composants propulsifs et des gaz comprimés.
Le cosmonaut ROSKOSMOS Alexander Misurkin (commandant de l'engin spatial, ROSCOSMOS) et les astronautes Mark Vande Hei et Joseph ACABA (ingénieurs de vol, NASA) membres de l'expédition ISS-53/54 ont essayé sur leurs combinaisons spatiales Sokol-KV et, suite au test de fuite spatiale, ont pris leur Endroits dans le véhicule. L'équipage a testé le système de radiocommunication, le système de mesure laser, s'est familiarisé avec les fichiers de bord, a étudié le programme de vol et une liste de marchandises à livrer à l'ISS.
Après l'entraînement, les équipages retourneront dans le centre de formation des Cosmonautes dans la Star City pour compléter la séance de formation et passer les examens et, le 6 septembre, ils retourneront au Cosmodrome de Baïkonour pour la phase finale d'entraînement avant le vol.
Dimanche, le 27 août, les membres d'équipage principal et de secours Soyouz-MS-06 sont arrivés au cosmodrome de Baïkonour. L'équipe de sauvegarde se compose du cosmonaute Anton Shkaplerov (commandant du vaisseau spatial, ROSCOSMOS) et des astronautes de la NASA Scott Tingle et Shannon Walker (ingénieurs de vol, NASA).
Le lancement de Soyuz MS-06 portant l'équipage de la prochaine tournée de longue durée à la Station spatiale internationale (ISS) est prévu le 13 septembre 2017 du site de lancement n ° 1 (Gagarin's Launch Pad) du cosmodrome de Baïkonour.